J'ai ce carré gris/noir au milieu de mon écran, lorsque je change de lieu de travail, il s'ensuit.
Ok, c'était de ma faute.
La superposition a été causée par gnome-screenshot fonctionnant toujours en arrière-plan après la création d'une capture d'écran.
Le problème est résolu en fermant toutes les istances de gnome-screenshot