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impossible de configurer Java pour R sous ubuntu 14.10

Problème: avant la mise à niveau, sous Ubuntu14.04, je viens d'installer le JRE et le JDK par défaut, et R 3.0.2 (la valeur par défaut pour cette version d'Ubuntu), et j'ai exécuté avec succès R CMD javareconf.

Cependant, depuis la mise à niveau vers 14.10 et la vérification que j'ai les derniers JRE et JDK Java7, essayer d'exécuter le javareconf échoue avec le vidage suivant:

cellocgw@cellocgw-Studio-1747:~$ Sudo R CMD javareconf
Java interpreter : /usr/bin/Java
Java version     : 1.7.0_65
Java home path   : /usr/lib/jvm/Java-7-openjdk-AMD64/jre
Java compiler    : /usr/bin/javac
Java headers gen.: /usr/bin/javah
Java archive tool: /usr/bin/jar

trying to compile and link a JNI progam 
detected JNI cpp flags    : -I$(Java_HOME)/../include
detected JNI linker flags : -L$(Java_HOME)/lib/AMD64/server -ljvm
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I/usr/lib/jvm/Java-7-openjdk-AMD64/jre/../include     -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c conftest.c -o conftest.o
In file included from conftest.c:1:0:
/usr/lib/jvm/Java-7-openjdk-AMD64/jre/../include/jni.h:39:19: fatal error: stdio.h: No such file or directory
 #include <stdio.h>
                   ^
compilation terminated.
/usr/lib/R/etc/Makeconf:133: recipe for target 'conftest.o' failed
make: *** [conftest.o] Error 1
Unable to compile a JNI program


Java_HOME        : /usr/lib/jvm/Java-7-openjdk-AMD64/jre
Java library path: 
JNI cpp flags    : 
JNI linker flags : 
Updating Java configuration in /usr/lib/R
Done.

Quelque chose n'est pas installé ou n'est pas là où il "devrait" être. J'ai essayé la plupart des astuces énumérées dans des questions similaires (faire des mises à jour et autres), mais jusqu'à présent, je n'ai pas trouvé de question où le stdio.h fichier manquant était le message d'erreur.

java14.10jdkr
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Carl Witthoft

Je pense que j'ai résolu cette situation:

Sur la base d'un commentaire de steeldriver, j'ai creusé dans le Software Center et ajouté plusieurs "add-ons" à l'installation de gcc. Je soupçonne que l'ajout de libc6-dev ou gcc-multilib était ce dont j'avais besoin.

Sur une note connexe susceptible d'intéresser les utilisateurs de R qui souhaitent installer JGR: j'ai dû installer au moins l'un des libpng12-dev, libpng3 , et libpng++dev pour obtenir le package png à installer (dans R), ce qui est requis pour JGR à installer.

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Carl Witthoft