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Comprendre les logs de Linux oom-killer

Mon application a été tuée par le tueur à mort. C'est Ubuntu 11.10 qui tourne sur une clé USB en direct sans permutation et le PC a 1 Go de RAM. La seule application en cours d'exécution (à part tous les éléments intégrés dans Ubuntu) est mon programme flasherav. Notez que/tmp est mappé sur la mémoire et qu’au moment de l’incident, elle contenait environ 200 Mo de fichiers (elle occupait donc environ 200 Mo de RAM).

J'essaie de comprendre comment analyser le journal om-killer de manière à comprendre exactement où toute la mémoire est utilisée, c.-à-d. Quels sont les différents morceaux qui s'ajouteront à environ 1 Go, ce qui a provoqué le coup de pied de tueur dans? Une fois que j'ai compris cela, je peux travailler à réduire l'utilisation du délinquant pour que l'application s'exécute sur une machine disposant de 1 Go de RAM. Mes questions spécifiques sont.

Pour essayer d'analyser la situation, j'ai résumé la colonne "total_vm" et je n'ai que 609342 Ko (qui, une fois ajouté à 200 Mo dans/tmp, ne représente encore que 809 Mo). Peut-être que je me trompe sur la colonne "total_vm" - inclut-elle la mémoire allouée mais non utilisée plus la mémoire partagée? Si oui, alors ne devrait-il pas exagérer la mémoire réellement utilisée (et donc je ne devrais pas être à court de mémoire), non? Existe-t-il d'autres morceaux de mémoire en cours d'utilisation qui ne figurent pas dans la liste ci-dessous?

[11686.040460] flasherav invoked oom-killer: gfp_mask=0x201da, order=0, oom_adj=0, oom_score_adj=0
[11686.040467] flasherav cpuset=/ mems_allowed=0
[11686.040472] Pid: 2859, comm: flasherav Not tainted 3.0.0-12-generic #20-Ubuntu
[11686.040476] Call Trace:
[11686.040488]  [<c10e1c15>] dump_header.isra.7+0x85/0xc0
[11686.040493]  [<c10e1e6c>] oom_kill_process+0x5c/0x80
[11686.040498]  [<c10e225f>] out_of_memory+0xbf/0x1d0
[11686.040503]  [<c10e6123>] __alloc_pages_nodemask+0x6c3/0x6e0
[11686.040509]  [<c10e78d3>] ? __do_page_cache_readahead+0xe3/0x170
[11686.040514]  [<c10e0fc8>] filemap_fault+0x218/0x390
[11686.040519]  [<c1001c24>] ? __switch_to+0x94/0x1a0
[11686.040525]  [<c10fb5ee>] __do_fault+0x3e/0x4b0
[11686.040530]  [<c1069971>] ? enqueue_hrtimer+0x21/0x80
[11686.040535]  [<c10fec2c>] handle_pte_fault+0xec/0x220
[11686.040540]  [<c10fee68>] handle_mm_fault+0x108/0x210
[11686.040546]  [<c152fa00>] ? vmalloc_fault+0xee/0xee
[11686.040551]  [<c152fb5b>] do_page_fault+0x15b/0x4a0
[11686.040555]  [<c1069a90>] ? update_rmtp+0x80/0x80
[11686.040560]  [<c106a7b6>] ? hrtimer_start_range_ns+0x26/0x30
[11686.040565]  [<c106aeaf>] ? sys_nanosleep+0x4f/0x60
[11686.040569]  [<c152fa00>] ? vmalloc_fault+0xee/0xee
[11686.040574]  [<c152cfcf>] error_code+0x67/0x6c
[11686.040580]  [<c1520000>] ? reserve_backup_gdb.isra.11+0x26d/0x2c0
[11686.040583] Mem-Info:
[11686.040585] DMA per-cpu:
[11686.040588] CPU    0: hi:    0, btch:   1 usd:   0
[11686.040592] CPU    1: hi:    0, btch:   1 usd:   0
[11686.040594] Normal per-cpu:
[11686.040597] CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd:   5
[11686.040600] CPU    1: hi:  186, btch:  31 usd:  30
[11686.040603] HighMem per-cpu:
[11686.040605] CPU    0: hi:   42, btch:   7 usd:   7
[11686.040608] CPU    1: hi:   42, btch:   7 usd:  22
[11686.040613] active_anon:113150 inactive_anon:113378 isolated_anon:0
[11686.040615]  active_file:86 inactive_file:1964 isolated_file:0
[11686.040616]  unevictable:0 dirty:0 writeback:0 unstable:0
[11686.040618]  free:13274 slab_reclaimable:2239 slab_unreclaimable:2594
[11686.040619]  mapped:1387 shmem:4380 pagetables:1375 bounce:0
[11686.040627] DMA free:4776kB min:784kB low:980kB high:1176kB active_anon:5116kB inactive_anon:5472kB active_file:0kB inactive_file:0kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:15804kB mlocked:0kB dirty:0kB writeback:0kB mapped:0kB shmem:0kB slab_reclaimable:80kB slab_unreclaimable:168kB kernel_stack:96kB pagetables:64kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:6 all_unreclaimable? yes
[11686.040634] lowmem_reserve[]: 0 865 1000 1000
[11686.040644] Normal free:48212kB min:44012kB low:55012kB high:66016kB active_anon:383196kB inactive_anon:383704kB active_file:344kB inactive_file:7884kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:885944kB mlocked:0kB dirty:0kB writeback:0kB mapped:5548kB shmem:17520kB slab_reclaimable:8876kB slab_unreclaimable:10208kB kernel_stack:1960kB pagetables:3976kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:930 all_unreclaimable? yes
[11686.040652] lowmem_reserve[]: 0 0 1078 1078
[11686.040662] HighMem free:108kB min:132kB low:1844kB high:3560kB active_anon:64288kB inactive_anon:64336kB active_file:0kB inactive_file:0kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:138072kB mlocked:0kB dirty:0kB writeback:0kB mapped:0kB shmem:0kB slab_reclaimable:0kB slab_unreclaimable:0kB kernel_stack:0kB pagetables:1460kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:61 all_unreclaimable? yes
[11686.040669] lowmem_reserve[]: 0 0 0 0
[11686.040675] DMA: 20*4kB 24*8kB 34*16kB 26*32kB 19*64kB 13*128kB 1*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 4784kB
[11686.040690] Normal: 819*4kB 607*8kB 357*16kB 176*32kB 99*64kB 49*128kB 23*256kB 4*512kB 0*1024kB 0*2048kB 2*4096kB = 48212kB
[11686.040704] HighMem: 16*4kB 0*8kB 1*16kB 0*32kB 0*64kB 0*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 80kB
[11686.040718] 14680 total pagecache pages
[11686.040721] 8202 pages in swap cache
[11686.040724] Swap cache stats: add 2191074, delete 2182872, find 1247325/1327415
[11686.040727] Free swap  = 0kB
[11686.040729] Total swap = 524284kB
[11686.043240] 262100 pages RAM
[11686.043244] 34790 pages HighMem
[11686.043246] 5610 pages reserved
[11686.043248] 2335 pages shared
[11686.043250] 240875 pages non-shared
[11686.043253] [ pid ]   uid  tgid total_vm      rss cpu oom_adj oom_score_adj name
[11686.043266] [ 1084]     0  1084      662        1   0       0             0 upstart-udev-br
[11686.043271] [ 1094]     0  1094      743       79   0     -17         -1000 udevd
[11686.043276] [ 1104]   101  1104     7232       42   0       0             0 rsyslogd
[11686.043281] [ 1149]   103  1149     1066      188   1       0             0 dbus-daemon
[11686.043286] [ 1165]     0  1165     1716       66   0       0             0 modem-manager
[11686.043291] [ 1220]   106  1220      861       42   0       0             0 avahi-daemon
[11686.043296] [ 1221]   106  1221      829        0   1       0             0 avahi-daemon
[11686.043301] [ 1255]     0  1255     6880      117   0       0             0 NetworkManager
[11686.043306] [ 1308]     0  1308     5988      144   0       0             0 polkitd
[11686.043311] [ 1334]     0  1334      723       85   0     -17         -1000 udevd
[11686.043316] [ 1335]     0  1335      730      108   0     -17         -1000 udevd
[11686.043320] [ 1375]     0  1375      663       37   0       0             0 upstart-socket-
[11686.043325] [ 1464]     0  1464     1333      120   1       0             0 login
[11686.043330] [ 1467]     0  1467     1333      135   1       0             0 login
[11686.043335] [ 1486]     0  1486     1333      135   1       0             0 login
[11686.043339] [ 1487]     0  1487     1333      136   1       0             0 login
[11686.043344] [ 1493]     0  1493     1333      134   1       0             0 login
[11686.043349] [ 1528]     0  1528      496       45   0       0             0 acpid
[11686.043354] [ 1529]     0  1529      607       46   1       0             0 cron
[11686.043359] [ 1549]     0  1549    10660      100   0       0             0 lightdm
[11686.043363] [ 1550]     0  1550      570       28   0       0             0 atd
[11686.043368] [ 1584]     0  1584      855       35   0       0             0 irqbalance
[11686.043373] [ 1703]     0  1703    17939     9653   0       0             0 Xorg
[11686.043378] [ 1874]     0  1874     7013      174   0       0             0 console-kit-dae
[11686.043382] [ 1958]     0  1958     1124       52   1       0             0 bluetoothd
[11686.043388] [ 2048]   999  2048     2435      641   1       0             0 bash
[11686.043392] [ 2049]   999  2049     2435      595   0       0             0 bash
[11686.043397] [ 2050]   999  2050     2435      587   1       0             0 bash
[11686.043402] [ 2051]   999  2051     2435      634   1       0             0 bash
[11686.043406] [ 2054]   999  2054     2435      569   0       0             0 bash
[11686.043411] [ 2155]     0  2155     1333      128   0       0             0 login
[11686.043416] [ 2222]     0  2222      684       67   1       0             0 dhclient
[11686.043420] [ 2240]   999  2240     2435      415   0       0             0 bash
[11686.043425] [ 2244]     0  2244     3631       58   0       0             0 accounts-daemon
[11686.043430] [ 2258]   999  2258    11683      277   0       0             0 gnome-session
[11686.043435] [ 2407]   999  2407      964       24   0       0             0 ssh-agent
[11686.043440] [ 2410]   999  2410      937       53   0       0             0 dbus-launch
[11686.043444] [ 2411]   999  2411     1319      300   1       0             0 dbus-daemon
[11686.043449] [ 2413]   999  2413     2287       88   0       0             0 gvfsd
[11686.043454] [ 2418]   999  2418     7867      123   1       0             0 gvfs-Fuse-daemo
[11686.043459] [ 2427]   999  2427    32720      804   0       0             0 gnome-settings-
[11686.043463] [ 2437]   999  2437    10750      124   0       0             0 gnome-keyring-d
[11686.043468] [ 2442]   999  2442     2321      244   1       0             0 gconfd-2
[11686.043473] [ 2447]     0  2447     6490      156   0       0             0 upowerd
[11686.043478] [ 2467]   999  2467     7590       87   0       0             0 dconf-service
[11686.043482] [ 2529]   999  2529    11807      211   0       0             0 gsd-printer
[11686.043487] [ 2531]   999  2531    12162      587   0       0             0 metacity
[11686.043492] [ 2535]   999  2535    19175      960   0       0             0 unity-2d-panel
[11686.043496] [ 2536]   999  2536    19408     1012   0       0             0 unity-2d-launch
[11686.043502] [ 2539]   999  2539    16154     1120   1       0             0 nautilus
[11686.043506] [ 2540]   999  2540    17888      534   0       0             0 nm-applet
[11686.043511] [ 2541]   999  2541     7005      253   0       0             0 polkit-gnome-au
[11686.043516] [ 2544]   999  2544     8930      430   0       0             0 bamfdaemon
[11686.043521] [ 2545]   999  2545    11217      442   1       0             0 bluetooth-Apple
[11686.043525] [ 2547]   999  2547      510       16   0       0             0 sh
[11686.043530] [ 2548]   999  2548    11205      301   1       0             0 gnome-fallback-
[11686.043535] [ 2565]   999  2565     6614      179   1       0             0 gvfs-gdu-volume
[11686.043539] [ 2567]     0  2567     5812      164   1       0             0 udisks-daemon
[11686.043544] [ 2571]     0  2571     1580       69   0       0             0 udisks-daemon
[11686.043549] [ 2579]   999  2579    16354     1035   0       0             0 unity-panel-ser
[11686.043554] [ 2602]     0  2602     1188       47   0       0             0 Sudo
[11686.043559] [ 2603]     0  2603   374634   181503   0       0             0 flasherav
[11686.043564] [ 2607]   999  2607    12673      189   0       0             0 indicator-appli
[11686.043569] [ 2609]   999  2609    19313      311   1       0             0 indicator-datet
[11686.043573] [ 2611]   999  2611    15738      225   0       0             0 indicator-messa
[11686.043578] [ 2615]   999  2615    17433      237   1       0             0 indicator-sessi
[11686.043583] [ 2627]   999  2627     2393      132   0       0             0 gvfsd-trash
[11686.043588] [ 2640]   999  2640     1933       85   0       0             0 geoclue-master
[11686.043592] [ 2650]     0  2650     2498     1136   1       0             0 mount.ntfs
[11686.043598] [ 2657]   999  2657     6624      128   1       0             0 telepathy-indic
[11686.043602] [ 2659]   999  2659     2246      112   0       0             0 mission-control
[11686.043607] [ 2662]   999  2662     5431      346   1       0             0 gdu-notificatio
[11686.043612] [ 2664]     0  2664     3716     2392   0       0             0 mount.ntfs
[11686.043617] [ 2679]   999  2679    12453      197   1       0             0 zeitgeist-datah
[11686.043621] [ 2685]   999  2685     5196     1581   1       0             0 zeitgeist-daemo
[11686.043626] [ 2934]   999  2934    16305      710   0       0             0 gnome-terminal
[11686.043631] [ 2938]   999  2938      553        0   0       0             0 gnome-pty-helpe
[11686.043636] [ 2939]   999  2939     1814      406   0       0             0 bash
[11686.043641] Out of memory: Kill process 2603 (flasherav) score 761 or sacrifice child
[11686.043647] Killed process 2603 (flasherav) total-vm:1498536kB, anon-rss:721784kB, file-rss:4228kB
64
Corey Velan

La gestion de la mémoire sous Linux est un peu difficile à comprendre, et je ne peux pas dire que je le comprenne encore, mais je vais essayer de partager un peu de mon expérience et de mes connaissances.

Réponse courte à votre question: Oui, il y a autre chose que ce qui est dans la liste.

Dans votre liste, les applications s'exécutent dans l'espace utilisateur. Le noyau utilise la mémoire pour lui-même et ses modules. En plus de cela, il a également une limite inférieure de mémoire libre que vous ne pouvez pas utiliser. Une fois ce niveau atteint, il essaiera de libérer des ressources. Lorsqu'il ne pourra plus le faire, vous rencontrerez un problème de MOO.

Sur la dernière ligne de votre liste, vous pouvez lire que le noyau indique une utilisation totale de vm de: 1498536 Ko (1,5 Go), où total-vm inclut à la fois votre espace physique RAM et votre espace d'échange. Vous avez indiqué que vous n'aviez aucun échange, mais le noyau semble penser le contraire, car votre espace d'échange est saturé (échange total = 524284 Ko, échange libre = 0 Ko) et indique une taille totale de vmem de 1,5 Go. 

Une autre chose qui peut compliquer davantage les choses est la fragmentation de la mémoire. Vous pouvez utiliser le tueur OOM lorsque le noyau tente d'allouer une mémoire continue de 4 096 Ko, mais il n'y a pas de mémoire libre disponible.

Maintenant, cela seul ne vous aidera probablement pas à résoudre le problème actuel. Je ne sais pas s'il est normal que votre programme nécessite autant de mémoire, mais je vous recommande d'essayer un analyseur de code statique tel que cppcheck pour vérifier les fuites de mémoire ou les descripteurs de fichier. Vous pouvez également essayer de l'exécuter via Valgrind pour obtenir un peu plus d'informations sur l'utilisation de la mémoire.

28
Jite

La somme de total_vm est égale à 847170 et la somme de rss à 214726, ces deux valeurs sont comptées dans des pages de 4 Ko, ce qui signifie que, lorsque oom-killer était en cours d'exécution, vous aviez utilisé 214726 * 4 Ko = 858904 Ko d'espace mémoire.

Étant donné que votre mémoire physique est de 1 Go et que vous avez utilisé environ 200 Mo pour le mappage de la mémoire, il est raisonnable d'appeler oom-killer lors de l'utilisation de 858904ko.

rss pour le processus 2603 est 181503, ce qui signifie 181503 * 4 Ko = 726012 rss, était égale à la somme de anon-rss et file-rss.

[11686.043647] Le processus tué 2603 (flasherav) total-vm: 1498536kB, anon-rss: 721784kB, fichier-rss: 4228kB

19
WKPlus

Cette page Web a une explication et une solution.

La solution est:

Pour résoudre ce problème, le comportement du noyau doit être modifié afin qu'il ne surcharge plus la mémoire pour les requêtes d'application. Enfin, j'ai inclus ces valeurs mentionnées dans le fichier /etc/sysctl.conf afin qu'elles soient automatiquement appliquées au démarrage:

vm.overcommit_memory = 2

vm.overcommit_ratio = 80

6
KiNG