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Impossible d'installer les paquets R dans Ubuntu 18.04

Problème

Impossible d'installer quelques packages R (langage de programmation statistique) depuis la mise à jour de 16.04 à buntu 18.04. Le problème est lié à l'utilisation de la bibliothèque partagée libcurlname__. Plus précisément:

/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcurl.so.4: version `CURL_OPENSSL_3' not    
found (required by /home/avila/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/curl
/libs/curl.so)

sofar, j'ai essayé ...

  • ... pour installer une version précédente de libcurl avec Sudo apt-get install libcurl3, mais d'autres bibliothèques ont été désinstallées lors de la procédure et R n'était pas utilisable.

sortie d'erreur

Lorsque vous essayez d'installer un paquet appelé "prevision", par exemple:

install.packages("forecast")
 installing to /home/avila/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/forecast/libs
** R
** data
*** moving datasets to lazyload DB
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) :  unable to load shared
object '/home/avila/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/curl/libs/curl.so':
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libcurl.so.4: version `CURL_OPENSSL_3' not    
found (required by /home/avila/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/curl
/libs/curl.so)

ERROR: lazy loading failed for package ‘forecast’
* removing ‘/home/avila/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/forecast’
Warning in install.packages :
installation of package ‘forecast’ had non-zero exit status

autre info:

  • R version 3.4.4 (2018-03-15)
  • Plate-forme: x86_64-pc-linux-gnu (64 bits)
package-management18.04shared-librarycurlr
11
Marcelo Avila

Il semble que pour obtenir des résultats prédictifs, vous souhaitiez peut-être commencer par renommer votre bibliothèque personnelle R existante par:

mv /home/$USER/R /home/$USER/R_old

Installez également le paquet de développement de curl:

Sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev

Ensuite, essayez d’installer votre paquet R à partir de R- terminal:

$ R
install.packages("forecast")
5
N0rbert

Ma résolution est venue des conseils de Rstudio: https://community.rstudio.com/t/error-version-curl-openssl-3-not-found/809

Le simple fait de supprimer le package R curl et de le réinstaller (avec devtools etc.) a tout réglé.

2
chepyle

Je répare mon problème après l'exécution: install.packages("RCurl")

0
Fábio