web-dev-qa-db-fra.com

comment changer les couleurs des bords ponctuels dans les diagrammes de dispersion nés de la mer?

J'ai créé un nuage de points en utilisant Seaborn:

import seaborn as sns
sns.set(style="ticks", color_codes=True)

g=sns.scatterplot(x="length", y="coverage", data=df, hue = 'Products', edgecolors=None, alpha = 0.7)
g.set(yscale="log")
plt.xlabel("Length(bp)")
plt.ylabel("Coverage")
plt.legend(loc = 'lower right')
plt.savefig('ATN_plot.png',dpi = 600)

Les données originales (partielles):

contig  length  coverage    pathway Products
53  1230    2423    stigmatellin    Yes
58  1195    885 curacin Yes
65  1161    598 jamaicamide Yes
68  1159    8001    jamaicamide Yes
79  1113    1423    curacin Yes
105 1042    1106    stigmatellin    Yes
727 666 223 HSAF (heat stable antifungal factor)    Yes
787 655 37  curacin Yes
791 654 13  stigmatellin    Yes
798 652 49  stigmatellin    Yes
844 642 5774    jamaicamide Yes
89  1090    13  No  No
90  1089    10  No  No
91  1086    26  No  No
92  1080    16  No  No
93  1079    10  No  No
94  1079    13  No  No

Et l'intrigue finale ressemble à ceci:

enter image description here

Je n'aime pas le bord blanc des taches. La partie inférieure gauche de l'image où la plupart des taches s'accumulent semble trop blanche. J'ai déjà inclus "edgecolors = None" dans mon code mais cela ne semble pas fonctionner. Quelqu'un sait-il comment supprimer la couleur du bord ou la changer en d'autres?

Merci beaucoup!

pythonseabornscatter-plot
16
Steve Xu

Remplacer edgecolors=None avec linewidth=0

Quelque chose comme:

g=sns.scatterplot(x="length", y="coverage", data=df, hue = 'Products', 
                  linewidth=0, alpha = 0.7)
17
Lucas

Dans matplotlib, la plupart des arguments prennent None comme dans "use the default". Alors qu'ici, vous ne voulez pas utiliser la valeur par défaut, mais plutôt pas edgecolor. Cela se fait via "none".

sns.scatterplot(..., edgecolor="none")
9
ImportanceOfBeingErnest

Vous pouvez changer la couleur d'accompagnement en passant des kwargs (arguments de mots clés)

kwargs  =   {'edgecolor':"r", # for Edge color
             'linewidth':2.7, # line width of spot
             'linestyle':'--', # line style of spot
            }
sns.scatterplot(x = "tip", y = "total_bill", data = tips_df, hue = "sex", 
                size ="sex", sizes = (100, 300), palette = "nipy_spectral" ,**kwargs)

ou vous pouvez le passer directement en tant que paramètres, comme:

sns.scatterplot(x = "tip", y = "total_bill", data = tips_df, hue = "sex", 
                size ="sex", sizes = (100, 300), palette = "nipy_spectral",
                edgecolor='r',
                linewidth=2,
                linestyle='--',)

Sortie >>>

enter image description here

J'espère, j'ai clarifié votre doute.

4
Rudra Mohan