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Erreur lors de l'installation de mpi4py

J'essaie d'installer mpi4py à l'aide de pip install mpi4py, mais le message d'erreur suivant s'affiche: 

error: Cannot find 'mpi.h' header. Check your configuration!!!

Plus tôt dans le même rapport d'erreur que j'ai,

clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see    invocation)

Quel pourrait être le problème? 

Merci!

pythonmacosinstallationmpi
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nargles324

J'ai rencontré le même problème et j'ai tout d'abord résolu le problème 

brew install mpich

Et alors 

pip install mpi4py
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American curl

Comme le dit l'erreur, il manque des bibliothèques. Je l'ai résolu en installant le paquet libopenmpi-dev

Sudo apt install libopenmpi-dev

puis installé le mpi4py en utilisant pip

Sudo pip install mpi4py
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user2848056

tu peux le faire:

brew install mpich

puis 

Sudo find / -name mpicc

enfin

env MPICC=/yourpath/mpicc pip3 install mpi4py
3
demonchang

Si mpi4py ne parvient pas à trouver le fichier mpi.h, le problème est probablement de savoir comment vous pointez mpi4py vers votre bibliothèque mpi existante.

$ python setup.py build --mpicc=/where/you/have/mpicc

À présent, il existe quelques cas particuliers liés à OS X. Vous devriez consulter http://mpi4py.scipy.org/docs/usrman/install.html pour voir s’ils s’appliquent.

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Rob Latham

Si quelqu'un tombe et a le même problème que moi:

Je voulais installer mpi4py en utilisant pip en tant que root:

Sudo pip install mpi4py

J'ai reçu le message d'erreur indiquant que mpi.h était manquant lors de l'installation. Le chemin a été défini correctement, mais uniquement pour mon utilisateur, pas pour root. Par conséquent, si vous rencontrez des problèmes avec des bibliothèques/en-têtes manquants au cours de toute installation, assurez-vous que l'environnement approprié est également configuré pour root.

Comme j'utilise mpi-selector pour sélectionner l'implémentation mpi que vous utilisez, il me suffisait d'exécuter mpi-selector en tant que root pour tout configurer correctement, et l'installation a réussi.

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thepith