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Impossible d'importer des modules dans le bloc-notes jupyter; mauvais sys.path

Je rencontre un problème lors de l'importation de modules dans mon bloc-notes iPython/Jupyter. Le problème réside essentiellement dans la direction vers laquelle pointe sys.path.

Depuis le bloc-notes iPython/Jupyter, sys.executable Retour:

'/usr/bin/python'

Cependant, à partir de la ligne de commande, il renvoie:

'//anaconda/bin/python'

J'ai essayé de désinstaller et de réinstaller anacondas, mais le problème persiste.

J'ai également essayé d'augmenter $ PYTHONPATH dans mon bash_profile pour inclure // anaconda/bin/python, mais cela ne le résout pas.

Existe-t-il de toute façon de modifier le sys.path dans mon carnet jupyter de façon permanente, sans simplement utiliser sys.path.append (...)?

pythonipython-notebookjupyter-notebook
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runawaykid

  1. Ouvrez une nouvelle fenêtre de terminal et voyez si cela aide. Sinon, passez à l'étape 2.

  2. Démarrez une session standard Python à partir du terminal et tapez ceci:

    >>> import sys
>>> sys.executable

  3. Faites de même dans le cahier:

    In [1]: import sys
        sys.executable

  4. Comparez les résultats. Espérons que cela vous donne une idée de ce qui se passe.

3
Mike Müller

J'ai eu le même problème. Après avoir traversé de nombreuses (comme beaucoup trop) de solutions à ce problème trouvées ailleurs, je parviens à trouver une solution qui fonctionne au moins dans mon cas.

Étape 1: vérifiez le chemin exécutable correct de l'environnement anaconda.

Allez sur la ligne de commande, activez l'environnement conda qui pose problème et vérifiez le chemin exécutable correct pour l'environnement.

conda activate {envronment name};
puis sur python, (>>>) import sys;sys.executable

Par exemple, sous Linux, ce sera /media/{username}/{path-to}/anaconda3/envs/{environment name}/bin/python

Étape 2: corrigez le chemin exécutable pour les sessions jupyter.

À partir de la ligne de commande, vérifiez le chemin d'accès où kernel.json de votre environnement conda problématique est localisé.

jupyter kernelspec list

Par exemple sous Linux ce sera: /home/{username}/.local/share/jupyter/kernels/{environment name}

Ouvrez le kernel.json situé dans ce dossier et remplacez le chemin exécutable incorrect, comme indiqué ci-dessous.

{
 "argv": [
  "REPLACE-THIS-WITH-THE-CORRECT-EXECUTABLE-PATH",
  "-m",
  "ipykernel_launcher",
  "-f",
  "{connection_file}"
 ],
 "display_name": "heterodimers",
 "language": "python"
}

J'espère que cela fonctionne aussi dans votre cas.

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rraadd88