Étant donné un DataFrame avec une colonne "BoolCol", nous voulons trouver les index du DataFrame dans lesquels les valeurs de "BoolCol" == True
J'ai actuellement la façon itérative de le faire, qui fonctionne parfaitement:
for i in range(100,3000):
if df.iloc[i]['BoolCol']== True:
print i,df.iloc[i]['BoolCol']
Mais ce n'est pas la bonne façon de le faire. Après quelques recherches, j'utilise actuellement ce code:
df[df['BoolCol'] == True].index.tolist()
Celui-ci me donne une liste d'index, mais ils ne correspondent pas, quand je les vérifie en faisant:
df.iloc[i]['BoolCol']
Le résultat est réellement faux !!
Quelle serait la bonne façon de faire ceci [Pandas]?
df.iloc[i]
renvoie la ligne ith
de df
. i
ne fait pas référence à l'étiquette d'index, i
est un index basé sur 0.
En revanche, l'attribut index
renvoie les étiquettes d'index réelles, et non des index de lignes numériques:
df.index[df['BoolCol'] == True].tolist()
ou équivalent,
df.index[df['BoolCol']].tolist()
Vous pouvez voir la différence très clairement en jouant avec un DataFrame avec un index autre que celui par défaut qui n'est pas égal à la position numérique de la ligne:
df = pd.DataFrame({'BoolCol': [True, False, False, True, True]},
index=[10,20,30,40,50])
In [53]: df
Out[53]:
BoolCol
10 True
20 False
30 False
40 True
50 True
[5 rows x 1 columns]
In [54]: df.index[df['BoolCol']].tolist()
Out[54]: [10, 40, 50]
Si vous voulez utiliser l'index,
In [56]: idx = df.index[df['BoolCol']]
In [57]: idx
Out[57]: Int64Index([10, 40, 50], dtype='int64')
vous pouvez alors sélectionner les lignes en utilisant loc
au lieu de iloc
:
In [58]: df.loc[idx]
Out[58]:
BoolCol
10 True
40 True
50 True
[3 rows x 1 columns]
Notez que loc
peut également accepter les tableaux booléens:
In [55]: df.loc[df['BoolCol']]
Out[55]:
BoolCol
10 True
40 True
50 True
[3 rows x 1 columns]
Si vous avez un tableau booléen, mask
, et avez besoin de valeurs d'index ordinales, vous pouvez les calculer en utilisant np.flatnonzero
:
In [110]: np.flatnonzero(df['BoolCol'])
Out[112]: array([0, 3, 4])
Utilisez df.iloc
pour sélectionner les lignes par index ordinal:
In [113]: df.iloc[np.flatnonzero(df['BoolCol'])]
Out[113]:
BoolCol
10 True
40 True
50 True
Peut être fait en utilisant numpy where () function:
import pandas as pd
import numpy as np
In [716]: df = pd.DataFrame({"gene_name": ['SLC45A1', 'NECAP2', 'CLIC4', 'ADC', 'AGBL4'] , "BoolCol": [False, True, False, True, True] },
index=list("abcde"))
In [717]: df
Out[717]:
BoolCol gene_name
a False SLC45A1
b True NECAP2
c False CLIC4
d True ADC
e True AGBL4
In [718]: np.where(df["BoolCol"] == True)
Out[718]: (array([1, 3, 4]),)
In [719]: select_indices = list(np.where(df["BoolCol"] == True)[0])
In [720]: df.iloc[select_indices]
Out[720]:
BoolCol gene_name
b True NECAP2
d True ADC
e True AGBL4
Bien que vous n'ayez pas toujours besoin d'index pour une correspondance, mais insérez si vous avez besoin de:
In [796]: df.iloc[select_indices].index
Out[796]: Index([u'b', u'd', u'e'], dtype='object')
In [797]: df.iloc[select_indices].index.tolist()
Out[797]: ['b', 'd', 'e']
Tout d’abord, vous pouvez vérifier query
lorsque la colonne cible est de type bool
(PS: sur la façon de l’utiliser, veuillez vérifier lien )
df.query('BoolCol')
Out[123]:
BoolCol
10 True
40 True
50 True
Après avoir filtré le df d'origine par la colonne booléenne, nous pouvons choisir l'index.
df=df.query('BoolCol')
df.index
Out[125]: Int64Index([10, 40, 50], dtype='int64')
De plus, pandas a nonzero
, il suffit de sélectionner la position de la rangée True
et l’utiliser pour couper la DataFrame
ou index
df.index[df.BoolCol.nonzero()[0]]
Out[128]: Int64Index([10, 40, 50], dtype='int64')
Une méthode simple consiste à réinitialiser l'index du DataFrame avant le filtrage:
df_reset = df.reset_index()
df_reset[df_reset['BoolCol']].index.tolist()
Bit hacky, mais c'est rapide!