J'ai un fichier texte séparé par des tabulations que j'ai importé dans R. J'ai utilisé la commande suivante pour l'importation:
data = read.table(soubor, header = TRUE, sep = "\t", dec = ".", colClasses =c("numeric","numeric","character","Date","numeric","numeric"))
Lorsque j'exécute str(data)
pour vérifier les types de données de mes colonnes, j'obtiens:
'data.frame': 211931 obs. of 6 variables:
$ DataValue : num 0 0 0 0 0 0 0 0 0 NA ...
$ SiteID : num 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ VariableCode: chr "Sucho" "Sucho" "Sucho" "Sucho" ...
$ DateTimeUTC : Date, format: "2012-07-01" "2012-07-02" "2012-07-03" "2012-07-04" ...
$ Latitude : num 50.8 50.8 50.8 50.8 50.8 ...
$ Longitude : num 15.6 15.6 15.6 15.6 15.6 ...
Un échantillon reproductible des 20 premières lignes de mes données est ici:
mon_échantillon = dput (données [1:20,])
structure(list(DataValue = c(0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, NA, NA,
NA, NA, NA, NA, NA, NA, 0, 0, 0), SiteID = c(1, 1, 1, 1, 1, 1,
1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1), VariableCode = c("Sucho",
"Sucho", "Sucho", "Sucho", "Sucho", "Sucho", "Sucho", "Sucho",
"Sucho", "Sucho", "Sucho", "Sucho", "Sucho", "Sucho", "Sucho",
"Sucho", "Sucho", "Sucho", "Sucho", "Sucho"), DateTimeUTC = structure(c(15522,
15523, 15524, 15525, 15526, 15527, 15528, 15529, 15530, 15531,
15532, 15533, 15534, 15535, 15536, 15537, 15538, 15539, 15540,
15541), class = "Date"), Latitude = c(50.77, 50.77, 50.77, 50.77,
50.77, 50.77, 50.77, 50.77, 50.77, 50.77, 50.77, 50.77, 50.77,
50.77, 50.77, 50.77, 50.77, 50.77, 50.77, 50.77), Longitude = c(15.55,
15.55, 15.55, 15.55, 15.55, 15.55, 15.55, 15.55, 15.55, 15.55,
15.55, 15.55, 15.55, 15.55, 15.55, 15.55, 15.55, 15.55, 15.55,
15.55)), .Names = c("DataValue", "SiteID", "VariableCode", "DateTimeUTC",
"Latitude", "Longitude"), row.names = c(NA, 20L), class = "data.frame")
Maintenant, je veux filtrer ma table par date. Notez que j'exécute mon code dans une boucle for
. Tout d'abord, je sous-ensemble mes données avant le 1er juillet 2012 et j'effectue un traitement. Ensuite, je sous-ensemble mes données avant le 2 juillet et je fais un peu de traitement, etc.
startDate = as.Date("2012-07-01");
endDate = as.Date("2012-07-20");
all_dates = seq(startDate, endDate, 1);
#the following code I'm trying to run inside a loop...
for (j in 1:length(all_dates)) {
filterdate = all_dates[j];
my_subset = my_sample[my_sample$DateTimeUTC == filterdate,]
#now I want do do some processing on my_subset...
}
Mais le code ci-dessus renvoie un ensemble de données vide à partir de l'étape 7 de la boucle.
Ainsi, par exemple:
subset_one = my_sample[my_sample$DateTimeUTC == all_dates[6],]
renvoie: 3 obs of 6 variables
.
Mais, pour une raison inconnue, l'exemple:
subset_two = my_sample[my_sample$DateTimeUTC == all_dates[7],]
renvoie: 0 obs of 6 variables
.
(note: j'ai édité le code ci-dessus pour rendre mon problème 100% reproductible)
Des idées sur ce que je fais mal?
La solution suivante a résolu mon problème: Au lieu d'utiliser le type de données Date
, j'ai essayé d'utiliser le type de données POSIXct
. Voici l'exemple de code pour lire le fichier texte séparé par des tabulations, après quoi le sous-ensemble a fonctionné à toutes les étapes de ma boucle for
:
data = read.table("data.txt", header = TRUE, sep = "\t", dec = ".",
colClasses =c("numeric","numeric","character","POSIXct","numeric","numeric"));
startDate = as.POSIXct("2012-07-01");
endDate = as.POSIXct("2012-07-20");
all_dates = seq(startDate, endDate, 86400); #86400 is num of seconds in a day
#the following code I'm trying to run inside a loop...
for (j in 1:length(all_dates)) {
filterdate = all_dates[j];
my_subset = data[data$DateTimeUTC == filterdate,]
#now I want do do some processing on my_subset...
}