Les valeurs NA ne sont pas exclues dans «cor»
Pour simplifier, j'ai un ensemble de données qui se présente comme suit:
b <- 1:6
# > b
# [1] 1 2 3 4 5 6
jnk <- c(2, 4, 5, NA, 7, 9)
# > jnk
# [1] 2 4 5 NA 7 9
Quand j'essaye:
cor(b, jnk, na.rm=TRUE)
Je reçois:
> cor(b, jnk, na.rm=T)
Error in cor(b, jnk, na.rm = T) : unused argument (na.rm = T)
J'ai aussi essayé na.action = na.exclude, etc. Aucun ne semble fonctionner. Il serait vraiment utile de savoir quel est le problème et comment je peux le résoudre. Merci.
TL; DR: Utilisez à la place:
cor(b, jnk, use="complete.obs")
Lis ?cor:
cor(x, y = NULL, use = "everything",
method = c("pearson", "kendall", "spearman"))
Il n'a pas na.rm, il a use.
une chaîne de caractères optionnelle donnant une méthode de calcul des covariances en présence de valeurs manquantes. Ce doit être (une abréviation de) l'une des chaînes
"everything","all.obs","complete.obs","na.or.complete", ou"pairwise.complete.obs".
Choisissez-en un. Les détails de ce que chacun fait se trouvent dans la section Details de ?cor.
Juste pour être sûr que la réponse à cette question est claire.
Pour ignorer NA, utilisez
b <- 1:6
jnk <- c(2, 4, 5, NA, 7, 9)
cor(b, jnk, use="complete.obs")
[1] 0.9905977