Je souhaite utiliser le package devtools
. J'ai lancé les commandes suivantes:
> install.packages("devtools", dependencies = TRUE)
....
> library(devtools)
Error in library(devtools) : there is no package called ‘devtools’
Qu'est-ce que je fais mal?
Edit: voici les résultats de la réexécution de la commande install.packages
après le redémarrage de la session.
> install.packages("devtools", dependencies = TRUE)
Installing package into ‘/home/evanaad/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0’
(as ‘lib’ is unspecified)
--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
Warning: dependencies ‘roxygen2’, ‘BiocInstaller’, ‘rstudio’ are not available
also installing the dependencies ‘httr’, ‘RCurl’
trying URL 'http://cran.at.r-project.org/src/contrib/httr_0.2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 50183 bytes (49 Kb)
opened URL
==================================================
downloaded 49 Kb
trying URL 'http://cran.at.r-project.org/src/contrib/RCurl_1.95-4.1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 870915 bytes (850 Kb)
opened URL
==================================================
downloaded 850 Kb
trying URL 'http://cran.at.r-project.org/src/contrib/devtools_1.4.1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 105214 bytes (102 Kb)
opened URL
==================================================
downloaded 102 Kb
* installing *source* package ‘RCurl’ ...
** package ‘RCurl’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for curl-config... no
Cannot find curl-config
ERROR: configuration failed for package ‘RCurl’
* removing ‘/home/evanaad/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/RCurl’
ERROR: dependency ‘RCurl’ is not available for package ‘httr’
* removing ‘/home/evanaad/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/httr’
ERROR: dependencies ‘httr’, ‘RCurl’ are not available for package ‘devtools’
* removing ‘/home/evanaad/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/devtools’
The downloaded source packages are in
‘/tmp/RtmptvmTrA/downloaded_packages’
Warning messages:
1: In install.packages("devtools", dependencies = TRUE) :
installation of package ‘RCurl’ had non-zero exit status
2: In install.packages("devtools", dependencies = TRUE) :
installation of package ‘httr’ had non-zero exit status
3: In install.packages("devtools", dependencies = TRUE) :
installation of package ‘devtools’ had non-zero exit status
Comme suggéré par damienfrancois , j'ai installé libcurl4-gnutls-dev et le problème a été résolu.
EDIT (@dardisco)
Dans votre coquille:
apt-get -y build-dep libcurl4-gnutls-dev
apt-get -y install libcurl4-gnutls-dev
Si vous utilisez Ubuntu/Linux:
Sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev libssl-dev
Si vous utilisez CentOS:
Essayer:
Sudo yum -y install libcurl libcurl-devel
De nos jours (Ubuntu 14.04) il me faut les deux:
$ Sudo apt-get -y install libcurl4-gnutls-dev
$ Sudo apt-get -y install libssl-dev
Pour les utilisateurs d'ubuntu, exécutez cette commande dans votre terminal [testé dans UBUNTU 16.04]
Sudo apt-get -y install libcurl4-openssl-dev
poster cette bibliothèque d'installation comme vous le faites habituellement dans R en utilisant
install.packages("package name")
Pour ma boîte Debian Jessie, j'ai également inclus:
Sudo apt-get build-dep libxml2-dev
Allusion: La sortie de la console r-tool est assez détaillée, je vais donc vérifier s'il existe d'autres dépendances.
Ensuite, j'ai enfin compris:
> find_rtools()
[1] TRUE
La meilleure solution pour résoudre ce problème. Je cherchais le même problème. J'ai passé une journée et puis j'ai eu la solution. Maintenant, c'est bien.
Vérifiez votre version R sur le terminal bash si vous êtes sur Ubuntu ou Linux.
R --version
puis utilisez ces commandes
Sudo apt-get update
Sudo apt-get upgrade
Maintenant, vérifiez la nouvelle version de R. Utilisez cette commande
Sudo apt-cache showpkg r-base
Maintenant, mettez à jour le R uniquement.
Sudo apt-get install r-base
Maintenant, R sera mis à jour et l'erreur sera supprimée. Assurez-vous de cd
le chemin de la bibliothèque où vous voulez installer le nouveau paquet. De cette façon, dans le terminal bash. Essayez de créer le répertoire R dans le dossier de base, sinon ce sera la valeur par défaut. Localisez cet emplacement pour le paquet ~/R/lib /.
R
.libPaths("~/R/lib")
install.packages("devtools")
OU
install.packages("devtools", lib="~/R/lib")
CentOS 7: J'avais déjà installé les paquets de développement libcurl et gnutls, mais le message d'erreur "ne peut pas charger git2r.so" lors de l'installation de devtools dans R. J'ai dû les "réinstaller" pour que cela fonctionne:
Sudo yum reinstall gnutls-devel.x86_64
J'ai frappé ce problème avec Ubuntu 18.04 et aucune des réponses précédentes ne l'a résolu. Finalement, j'ai réussi à installer devtools
avec le gestionnaire de paquets lui-même:
Sudo apt install r-cran-devtools
Centos 6.8
ce travail comme un charme pour moi
$yum -y install libcurl libcurl-devel
$rstudio-server verify-installation