Je vais illustrer ma question avec un exemple.
Échantillon de données:
df <- data.frame(ID = c(1, 1, 2, 2, 3, 5), A = c("foo", "bar", "foo", "foo", "bar", "bar"), B = c(1, 5, 7, 23, 54, 202))
df
ID A B
1 1 foo 1
2 1 bar 5
3 2 foo 7
4 2 foo 23
5 3 bar 54
6 5 bar 202
Ce que je veux faire est de résumer, par ID, la somme de B et la somme de B lorsque A est "foo". Je peux le faire en quelques étapes comme:
require(magrittr)
require(dplyr)
df1 <- df %>%
group_by(ID) %>%
summarize(sumB = sum(B))
df2 <- df %>%
filter(A == "foo") %>%
group_by(ID) %>%
summarize(sumBfoo = sum(B))
left_join(df1, df2)
ID sumB sumBfoo
1 1 6 1
2 2 30 30
3 3 54 NA
4 5 202 NA
Cependant, je recherche un moyen plus élégant/plus rapide, car je traite plus de 10 Go de données insuffisantes en mémoire SQL.
require(sqldf)
my_db <- src_sqlite("my_db.sqlite3", create = T)
df_sqlite <- copy_to(my_db, df)
J'ai pensé utiliser mutate
pour définir une nouvelle colonne Bfoo
:
df_sqlite %>%
mutate(Bfoo = ifelse(A=="foo", B, 0))
Malheureusement, cela ne fonctionne pas pour la base de données.
Error in sqliteExecStatement(conn, statement, ...) :
RS-DBI driver: (error in statement: no such function: IFELSE)
Ecrire le commentaire de @ hadley comme réponse
df_sqlite %>%
group_by(ID) %>%
mutate(Bfoo = if(A=="foo") B else 0) %>%
summarize(sumB = sum(B),
sumBfoo = sum(Bfoo)) %>%
collect
Vous pouvez faire les deux sommes en une seule instruction dplyr
:
df1 <- df %>%
group_by(ID) %>%
summarize(sumB = sum(B),
sumBfoo = sum(B[A=="foo"]))
Si vous voulez compter au lieu de résumer, la réponse est quelque peu différente. Le changement de code est faible, en particulier dans la partie de comptage conditionnel.
df1 <- df %>%
group_by(ID) %>%
summarize(countB = n(),
countBfoo = sum(A=="foo"))
df1
Source: local data frame [4 x 3]
ID countB countBfoo
1 1 2 1
2 2 2 2
3 3 1 0
4 5 1 0
Si vous voulez compter les lignes, au lieu de les additionner, pouvez-vous passer une variable à la fonction:
df1 <- df %>%
group_by(ID) %>%
summarize(RowCountB = n(),
RowCountBfoo = n(A=="foo"))
Je reçois une erreur à la fois avec n()
et nrow()
.