supprimer la ligne avec une valeur nan
disons, par exemple, j'ai ces données:
data <- c(1,2,3,4,5,6,NaN,5,9,NaN,23,9)
attr(data,"dim") <- c(6,2)
data
[,1] [,2]
[1,] 1 NaN
[2,] 2 5
[3,] 3 9
[4,] 4 NaN
[5,] 5 23
[6,] 6 9
Maintenant, je veux supprimer les lignes contenant les valeurs NaN: lignes 1 et 4. Mais je ne sais pas où sont ces lignes, si c'est un ensemble de données de 100 000+ lignes, donc je dois les trouver avec une fonction et supprimer la ligne complète.
Quelqu'un peut-il m'orienter dans la bonne direction?
La fonction complete.cases vous indiquera où se trouvent les lignes dont vous avez besoin:
data <- matrix(c(1,2,3,4,5,6,NaN,5,9,NaN,23,9), ncol=2)
data[complete.cases(data), ]
[,1] [,2]
[1,] 2 5
[2,] 3 9
[3,] 5 23
[4,] 6 9
LES DONNÉES
data <- matrix(rnorm(100000000), ncol=10000)
idx <- sample(1:10000,100)
idy <- sample(1:10000,100)
data[idx,idy] <- NaN
UNE FONCTION
foo <- function(d=data) d[apply(d,2,function(x) any(is.nan(x))),]
DUREES
> system.time(data[complete.cases(data),])
user system elapsed
3.53 0.12 3.65
> system.time(foo(data))
user system elapsed
2.37 0.09 2.46