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Tracer plusieurs colonnes sur le même graphique en R

J'ai le cadre de données suivant:

A       B       C       D       Xax
0.451   0.333   0.034   0.173   0.22        
0.491   0.270   0.033   0.207   0.34    
0.389   0.249   0.084   0.271   0.54    
0.425   0.819   0.077   0.281   0.34
0.457   0.429   0.053   0.386   0.53    
0.436   0.524   0.049   0.249   0.12    
0.423   0.270   0.093   0.279   0.61    
0.463   0.315   0.019   0.204   0.23

J'ai besoin de tracer toutes ces colonnes dans le même tracé (sur l'axe des abscisses, je veux la variable Xax et sur l'axe des ordonnées les variables A, B, C et D) et de tracer la ligne de régression pour chaque variable seule.

J'ai essayé ceci:

pl<-ggplot(data=df) + geom_point(aes(x=Xax,y=A,size=10)) + 
  geom_point(aes(x=Xax,y=B,size=10)) + 
  geom_point(aes(x=Xax,y=C,size=10)) + 
  geom_point(aes(x=Xax,y=D,size=10)) + 
  geom_smooth(method = "lm", se=FALSE, color="black")

Mais il ne s'agit que du premier (Xax et A)

rggplot2
31
ifreak

Le plus simple est de convertir vos données en un format "grand".

s <- 
"A       B        C       G       Xax
0.451   0.333   0.034   0.173   0.22        
0.491   0.270   0.033   0.207   0.34    
0.389   0.249   0.084   0.271   0.54    
0.425   0.819   0.077   0.281   0.34
0.457   0.429   0.053   0.386   0.53    
0.436   0.524   0.049   0.249   0.12    
0.423   0.270   0.093   0.279   0.61    
0.463   0.315   0.019   0.204   0.23
"
d <- read.delim(textConnection(s), sep="")

library(ggplot2)
library(reshape2)
d <- melt(d, id.vars="Xax")

# Everything on the same plot
ggplot(d, aes(Xax,value, col=variable)) + 
  geom_point() + 
  stat_smooth() 

# Separate plots
ggplot(d, aes(Xax,value)) + 
  geom_point() + 
  stat_smooth() +
  facet_wrap(~variable)
46
Vincent Zoonekynd

Une solution très simple:

df <- read.csv("df.csv",sep=",",head=T)
x <- cbind(df$Xax,df$Xax,df$Xax,df$Xax)
y <- cbind(df$A,df$B,df$C,df$D)
matplot(x,y,type="p")

s'il vous plaît noter qu'il ne fait que tracer les données et il ne trace pas de ligne de régression.

12
Alessandro Jacopson

Utiliser tidyverse

df %>% tidyr::gather("id", "value", 1:4) %>% 
  ggplot(., aes(Xax, value))+
  geom_point()+
  geom_smooth(method = "lm", se=FALSE, color="black")+
  facet_wrap(~id)

LES DONN&EACUTE;ES

df<- read.table(text =c("
A       B       C       G       Xax
0.451   0.333   0.034   0.173   0.22        
0.491   0.270   0.033   0.207   0.34    
0.389   0.249   0.084   0.271   0.54    
0.425   0.819   0.077   0.281   0.34
0.457   0.429   0.053   0.386   0.53    
0.436   0.524   0.049   0.249   0.12    
0.423   0.270   0.093   0.279   0.61    
0.463   0.315   0.019   0.204   0.23"), header = T)
2
aelwan

Pour sélectionner les colonnes à tracer, j'ai ajouté 2 lignes à la réponse de Vincent Zoonekynd:

#convert to tall/long format(from wide format)
col_plot = c("A","B")
dlong <- melt(d[,c("Xax", col_plot)], id.vars="Xax")  

#"value" and "variable" are default output column names of melt()
ggplot(dlong, aes(Xax,value, col=variable)) +
  geom_point() + 
  geom_smooth()

Google "données ordonnées" pour en savoir plus sur le format haut (ou long)/large.

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user3226167