web-dev-qa-db-fra.com

"Statut de sortie autre que zéro" R 3.0.1 'XML' et 'RCurl'

J'ai un peu de mal à installer XML et RCurl sur ma machine Ubuntu 13.10. J'ai effectué toutes les mises à jour et mises à niveau Sudo aujourd'hui.

J'essaie d'utiliser un hochet pour R. Je ne parviens pas à installer le 'XML' nécessaire à l'utilisation d'un hochet. C'est à peu près la même question qui a été posée ici juste un an plus tard et un système d'exploitation différent. Voici les messages d'erreur que je reçois:

> install.packages("RCurl")
Installing package into ‘/home/steven/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/RCurl_1.95-4.1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 870915 bytes (850 Kb)
opened URL
==================================================
downloaded 850 Kb

* installing *source* package ‘RCurl’ ...
** package ‘RCurl’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for curl-config... no
Cannot find curl-config
ERROR: configuration failed for package ‘RCurl’
* removing ‘/home/steven/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/RCurl’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘RCurl’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpUwBkbS/downloaded_packages’
> install.packages("XML")
Installing package into ‘/home/steven/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/XML_3.98-1.1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1582216 bytes (1.5 Mb)
opened URL
==================================================
downloaded 1.5 Mb

* installing *source* package ‘XML’ ...
** package ‘XML’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... 
rm: cannot remove 'a.out.dSYM': Is a directory
a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables... 
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ISO C89... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
checking for sed... /bin/sed
checking for pkg-config... /usr/bin/pkg-config
checking for xml2-config... no
Cannot find xml2-config
ERROR: configuration failed for package ‘XML’
* removing ‘/home/steven/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/XML’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘XML’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpUwBkbS/downloaded_packages’

Pas trop sûr sur la façon de procéder à partir d'ici.

xmllinuxrrcurlinstall.packages
66
MCP_infiltrator

Pour installer curl et xml sur Ubuntu. Courir

Sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev libxml2-dev

Les messages d'erreur sur l'installation du paquet dans R indiquent que les bibliothèques curl et xml ne sont pas présentes ou sont introuvables.

114
jdharrison

Dans CentOS 6+, vous pouvez le faire en utilisant

Sudo yum -y install curl
Sudo yum -y install libcurl libcurl-devel
Sudo yum -y install libxml2 libxml2-devel
27
Jijo

Pour ceux qui ne peuvent pas installer avec yum ou apt-get, Je partage mon expérience:

J'ai installé libcurl-openssl-dev moi-même en téléchargeant le code source et en compilant. J'ai encore couru dans le Cannot find curl-config problème cependant ... Je ne savais pas quoi faire avant de regarder le code source de RCurl et de voir un CURL_CONFIG variable d’environnement référencée. J'ai essayé de mettre cela moi-même dans mon .bashrc et cela semble avoir fonctionné:

export CURL_CONFIG=~/my/libcurl/curl-config

2
kjohnsen